Az Elfen Lied nem kislányoknak való anime.A gyengébb idegzetűek ne nézzék meg,vagy ha megnézték próbálják elfelejteni a látottakat.

Az anime főszereplője egy Lucy nevű diclonius.De az egész történet a dicloniusok körül bonyolódik.Lucyt gyerekkorában bántották,csúfolták nem hagyták békén a fején lévő szarvai miatt.Egyszer talált egy kiskutyát,de nem mondta el senkinek.Azonban egy lánynak mégis elmondta,mert megbízott benne.A lány viszont elmondta 3 fiúnak akik utálták Lucyt.Mikor Lucy egyedül volt bevitték a kutyát és a szeme láttára megölték.Odament az "áruló"lány is,vesztére,mert Lucy mindenkit megölt.Őt sem kímélte.Eltemette a kutyát és a városban lévő összes boldog embert megölte.Volt egy fiú Kouta ,aki iránt gyengéd érzelmeket táplált és Kanae,Kouta húga mindent látott amit Lucy tett.Mikor elakarta mondani Koutának a látottakat, odament Lucy és Kouta szeme láttára végzett a húgával és a nagyapjával is.

Később Lucy megismert egy lányt akit nem érdekelte,hogy Lucy diclonius.Lucy barátja akart lenni.Hamar összebarátkoztak,de nem tartott sokáig ez a barátság.Kurama emberei megtalálták őket és a lány megakarta védeni Lucyt,de oldalról lelőtték.Kurama alkut kötött Lucyval,hogy ha megmentik a lányt akkor Lucy velük megy.A lány mégis meghalt.Lucy megfogadta Kuramának,hogy egyszer kiszabadul és mindenkit megöl akit szeret.

Néhány évvel később,a kutatólaboratóriumban,ahol Lucyt őrizték egy őr túl közel merészkedett a lányhoz.Lucy kiszabadult,és mindenkit megölt aki az útjában állt.Kivéve Kuramát.Egy mesterlövész mégis tarkónlőtte és a tengerbe zuhant.Másnap a tenger a Japán partokra sodorta.A parton Kouta,és unokatestvére Yuka találtak a lányra.Mivel Lucy tudata kettéhasadt,ezért Koutáék nem a gyilkos Lucyra találtak,hanem egy esetlen kislányra.Mivel nem tudott mást mondani,csak azt,hogy nyu ezért elnevezték Nyuunak.Hazavitték a lányt,de mivel évekkel ezelőtt Koutát sokk érte ő sem ismerte fel családja gyilkosát.Nyuu nagyon gyerekes dolgokat csinál.De mégis ha beüti a fejét,akkor újra önmaga lesz,a kegyetlen diclonius Lucy.Mikor Nyuu eltöri Kouta kagylóját(amit Kanaétól kapott)Kouta a lányra támad,és Nyuu elfut.A parton talál rá ahol Nyuu egy hasonló kagylót ad Koutának.Vagyis akar adni mivel egy katona leüti.Magával viszi a lányt.A katona,akit Bandounak hívnak kényszeríti a lányt,hogy használja erejét.Mivel Nyuu ne érti mit mond nem is tudja használni,de ha értené se tudná.Bandou a rácsnak vágja Nyuut,de mivel beüti a fejét Lucyvá változik.Kegyetlenül elbánik Bandouval.Letépi az egyik karját és kiszúrja a szemeit.Mayu aki a történet negyedik főszereplője segít a katonának,és bekötözi a karját.

Nem sokkal később Kurama egy másik dicloniust küld Lucy után,hogy végezzen vele.Ő Nana.Nana viszont csak azt ígéri meg neki,hogy visszaviszi a lányt.Lucy vele is csúnyán elbánik.Letépi végtagjait.Kurama megszánja a lányát és pótvégtagokat adat neki.Később újra összehozza  a sors Lucyt és Nanat.Nana Nyuunak megy,mert nem tudja,hogy mi a helyzet vele.Nanat is befogadják.Nana jóbarátságot köt Mayval

Tehát már 5-en vagyis 6-an laknak Koutáék házában.Nyílván Kouta és az unokatestvér,Nyuu vagyis Lucy,Mayu aki azért szökött el otthonából,mert az anyukája nem szerette,és a nevelőapja molesztálta,Wanta Mayu kiskutyája és végül Nana a házban élő másik diclonius.

Telnek a napok és egy újabb diclonius tűnik fel a színen.Mariko.A 3 diclonius közül ő legveszélyesebb.Sokkal több és hosszabb vektora van,mint Lucynak vagy Nanának.És ő még élvezi is,hogy gyilkol.A csatájukban amit Lucy és Mariko vív,majdnem meghal Lucy.Az egyik szarvát le is töri.De a harc végén Mariko felrobban igazi apjával Kuramával együtt.Ráadásul Nana szeme láttára.

A történet végén Lucyt lelövik,de nem derül ki,hogy meghal-e.

Egyébként nem hal meg,mert van egy képem amin Kouta nem tudja eldönteni,hová menjen.Úgyértem az ajtó előtt van valaki,akinek a körvonala olyan,mint a Lucyé.